Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK16Q00536 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK16Q00536 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms