Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms