Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms