Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDLBPQ00341 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms