Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNB1P98172 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms