Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTNAP1P78357 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP1P78357 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP1P78357 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms