Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms