Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms