Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB4BP61018 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB4BP61018 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RAB4BP61018 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4BP61018 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4BP61018 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4BP61018 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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