Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP25P60880 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms