Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms