Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK4P57078 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms