Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIPPLY3P57055 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY3P57055 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY3P57055 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY3P57055 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RIPPLY3P57055 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY3P57055 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms