Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTBP2P56545 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTBP2P56545 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms