Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCGRTP55899 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FCGRTP55899 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms