Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATN1P54259 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATN1P54259 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATN1P54259 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATN1P54259 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms