Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTCL1P53675 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCL1P53675 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCL1P53675 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms