Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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