Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HK3P52790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HK3P52790 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HK3P52790 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HK3P52790 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HK3P52790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HK3P52790 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms