Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPNA1P52294 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA1P52294 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms