Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF1P51825 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF1P51825 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms