Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCAMP50895 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCAMP50895 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCAMP50895 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCAMP50895 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCAMP50895 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCAMP50895 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms