Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNBP48739 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms