Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCLMP48507 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCLMP48507 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCLMP48507 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCLMP48507 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCLMP48507 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLMP48507 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCLMP48507 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCLMP48507 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms