Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX2P48431 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX2P48431 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX2P48431 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX2P48431 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms