Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A9P48067 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms