Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THPOP40225 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THPOP40225 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
THPOP40225 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THPOP40225 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THPOP40225 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THPOP40225 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THPOP40225 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THPOP40225 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms