Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACVR1BP36896 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACVR1BP36896 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms