Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms