Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
THBS4P35443 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
THBS4P35443 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms