Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms