Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNB1P35222 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms