Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTGFP29279 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTGFP29279 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTGFP29279 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTGFP29279 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTGFP29279 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTGFP29279 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTGFP29279 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms