Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLD1P28340 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLD1P28340 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLD1P28340 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLD1P28340 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms