Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms