Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARK3P27448 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARK3P27448 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARK3P27448 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARK3P27448 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARK3P27448 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARK3P27448 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms