Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YY1P25490 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YY1P25490 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YY1P25490 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
YY1P25490 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YY1P25490 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YY1P25490 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YY1P25490 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YY1P25490 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YY1P25490 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms