Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRZ1P23471 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRZ1P23471 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms