Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TAF1P21675 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1P21675 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1P21675 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1P21675 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms