Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT1P21579 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT1P21579 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT1P21579 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT1P21579 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT1P21579 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms