Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCP20941 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCP20941 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCP20941 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCP20941 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCP20941 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCP20941 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms