Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DESP17661 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DESP17661 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DESP17661 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DESP17661 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DESP17661 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DESP17661 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms