Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD44P16070 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD44P16070 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD44P16070 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD44P16070 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD44P16070 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD44P16070 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD44P16070 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms