Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRF1P14222 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRF1P14222 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRF1P14222 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRF1P14222 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRF1P14222 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRF1P14222 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRF1P14222 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRF1P14222 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRF1P14222 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms