Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD8P13378 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms