Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT3P12035 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT3P12035 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT3P12035 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT3P12035 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms