Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAMP11215 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGAMP11215 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms