Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHGAP10645 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHGAP10645 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHGAP10645 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHGAP10645 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHGAP10645 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms