Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTXN2P0C2S0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN2P0C2S0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms