Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP10P09238 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP10P09238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MMP10P09238 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP10P09238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP10P09238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP10P09238 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP10P09238 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP10P09238 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP10P09238 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP10P09238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP10P09238 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP10P09238 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP10P09238 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms